Ngày 30/07/2024, nhóm các nhà nghiên cứu gồm tác giả Zuanny và các cộng sự đã công bố công cụ “expowo” trong việc hỗ trợ khai thác dữ liệu phân bố và đa dạng thực vật toàn cầu từ bộ cơ sở dữ liệu của Vườn thực vật hoàng gia KEW: Plants of the World Online (POWO).
“expowo” là một gói lệnh sử dụng trong phần mềm R, với mục tiêu chính là thu thập thông tin về sự đa dạng và phân bố của bất kỳ loài thực vật nào sẵn có tại POWO. Thông qua các hàm truy vấn đơn giản, gói lệnh có thể trả về danh sách đầy đủ các loài được chấp nhận trong bất kỳ chi hoặc họ nào, kèm theo các thông tin về tác giả, tài liệu công bố loài và sự phân bố ở cấp độ quốc gia trên toàn cầu của chúng. Gói lệnh này cũng hỗ trợ khai thác nhanh chóng thông tin về số lượng loài hiện có của bất kỳ chi nào có trong dữ liệu POWO, cũng như tạo các biểu đồ về độ giàu loài,…
Một số hàm truy vấn chính của gói lệnh gồm:
- topGen: Trích xuất các chi có nhiều loài nhất trên POWO
- powoFam: Trích xuất số lượng loài thuộc bất kỳ họ nào trên POWO
- powoGenera: Trích xuất danh sách các chi theo các họ có trên POWO
- powoSpecies: Trích xuất danh sách loài theo chi, họ trên POWO
- powoSpDist: Trích xuất thông tin về phân bố loài trên POWO
- powoMap: Tạo bản đồ toàn cầu về độ giàu loài
- accGraph: Tạo biểu đồ về số lượng loài được phát hiện mới tích lũy theo thời gian
Biểu đồ trình bày cấu trúc và các chức năng chính của “expowo”. Nguồn Zuanny et.al. 2024
Thông tin chi tiết về bài báo có thể tham khảo tại: Zuanny, D. C., B. Vilela, P. W. Moonlight, T. E. Särkinen, and D. Cardoso. 2024. expowo: An R package for mining global plant diversity and distribution data. Applications in Plant Sciences 12: e11609. https://doi.org/10.1002/aps3.11609
SIE/Xuân Bách